ارائه ی یک الگوریتم رقابت استعماری جهت پیشگویی ساختار فوق ثانویه ی پروتئین ها به کمک اطلاعات ساختاری قطعات با ساختار دوم
پایان نامه
- وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه کاشان - دانشکده مهندسی کامپیوتر
- نویسنده شیما امیرصدری
- استاد راهنما مرتضی بابامیر شهریار عرب
- تعداد صفحات: ۱۵ صفحه ی اول
- سال انتشار 1392
چکیده
پروتئینها ماکروملکولهایی هستند که تمام اعمال مهم در ارگانیسمها از جمله انتقال مواد غذایی، تشخیص و انتقال پیامها انجام میدهند. از آنجا که عملکرد پروتئینها وابسته به ساختار فضایی آنهاست، پیشگویی ساختار فضایی پروتئین حائز اهمیت است. هدف از این تحقیق پیشگویی ساختار پروتئین با استفاده از اطلاعات ساختاری ساختار دوم است. در روش پیشنهادی در این تحقیق، با استفاده از الگوریتم رقابت استعماری، تعدادی ساختار فوق ثانویه از پروتئین گرفته می شود و سپس بهترین ساختار فوق ثانویه پیش گویی می شود. برتری این روش نسبت به سایر روشهای موجود این است که اطلاعات ساختاری ساختار دوم به عنوان ورودی الگوریتم منجر به پیشگویی دقیقتری میشود که به ساختار فضایی پروتئین نزدیکتر است.
منابع مشابه
ارائه یک روش نوین جهت تعیین قوت واترمارک با استفاده از الگوریتم رقابت استعماری
Watermarking systems have specific feathers in accordance with their applications. In many applications transparency and robustness are needed which are the most important features. These two features are in contrast to each other and are controlled by a parameter named watermark strength. With decreasing the watermark strength, transparency of the watermarking system increases while the robust...
متن کاملپیشگویی دقیق ساختار دوم RNA مبتنی بر الگوریتم ژنتیک
مولکول RNA نقش مهم و اساسی در فرآیندهای زیستی ایفا می¬کند. در بیشتر مواقع، عملکرد RNAها توسط ساختار آنها مشخص می¬شود. با توجه به پیچیدگی و هزینه بر بودن روش¬های آزمایشگاهی برای پیشگویی ساختار RNAها، از روش¬های محاسباتی استفاده می¬گردد. الگوریتم¬های متنوعی جهت پیشگویی ساختار دوم مولکول RNA وجود دارد. در این مقاله، یک الگوریتم ژنتیک بنام RNAG جهت پیشگویی ساختار دوم مولکول RNA براساس حداقل انرژی ...
متن کاملکاربرد یک الگوریتم اصلاحی رقابت استعماری برای حل مسأله ی فروشنده دوره‌گرد
این مقاله یک روش رقابت استعماری اصلاح‌شده را برای حل مسأله فروشنده دوره‌گرد ارائه می کند که در تابع جذب بین کشورهای استعمارگر و استعمار شده و هم چنین انقلاب کشورهای مستعمره، با حالت معمولی خود تفاوت دارد. به علاوه برای افزایش کارایی الگوریتم از روش بهبود دهنده ی سه‌گانه استفاده میشود. الگوریتم جدید روی 19 مثال استاندارد مسأله فروشنده دوره‌گرد از کتابخانه TSPLIBمورد آزمایش و با الگوریتم‌های رقا...
متن کاملارائه ی یک روش نوین جهت تعیین ثوابت معیار شکست نرم لوله ی درزدار فلزی به کمک فرآیند هیدروبالجینگ
در پژوهش حاضر،به بررسی عددی و تجربی شکست نرم پیشرونده در فرآیند انبساطدهی آزاد لوله فولادی زنگنزن 304 درزدار، به کمک فشار روغن پرداخته شده است. در بخش عددی که از روش المان محدود لاگرانژی به کمک حلگر صریح نرمافزار آباکوس استفاده شد؛ درز جوش به صورت یک نوار نازک، حاوی ضریب ناهمگنی نقص در استحکام و شکلپذیری مدل گردید. از دیاگرام حد شکلدهی (FLD) به عنوان معیار شروع آسیب و از پارامتر جابهجای...
متن کاملپیشگویی دقیق ساختار دوم rna مبتنی بر الگوریتم ژنتیک
مولکول rna نقش مهم و اساسی در فرآیندهای زیستی ایفا می¬کند. در بیشتر مواقع، عملکرد rnaها توسط ساختار آنها مشخص می¬شود. با توجه به پیچیدگی و هزینه بر بودن روش¬های آزمایشگاهی برای پیشگویی ساختار rnaها، از روش¬های محاسباتی استفاده می¬گردد. الگوریتم¬های متنوعی جهت پیشگویی ساختار دوم مولکول rna وجود دارد. در این مقاله، یک الگوریتم ژنتیک بنام rnag جهت پیشگویی ساختار دوم مولکول rna براساس حداقل انرژی آ...
متن کاملساختار زبان شفیعی کدکنی در « هزاره ی دوم آهوی کوهی
در این مقاله، ابتدا با تکیه بر دو تعریف و توصیف دکتر شفیعی کدکنی از شعر، اولا" «زبان» به مثابه‌ی یکی از عنصرهای سازنده و نیز بستری که «شعر چونان حادثه‌ای در آن روی می‌دهد»، بررسی گردیده و ثانیا" به نقش ارتباطی و یگانه ساز آن در میان «نجواگر و شنونده»، اشاره شده است. بنابراین، مباحثی نظیر تفاوت زبان شعر و زبان روزمره، «نارسایی زبان در القای ما فی الضمیر»، «زبان و اندیشه» و «زبان و جامعه» به ا...
متن کاملمنابع من
با ذخیره ی این منبع در منابع من، دسترسی به آن را برای استفاده های بعدی آسان تر کنید
ذخیره در منابع من قبلا به منابع من ذحیره شده{@ msg_add @}
نوع سند: پایان نامه
وزارت علوم، تحقیقات و فناوری - دانشگاه کاشان - دانشکده مهندسی کامپیوتر
میزبانی شده توسط پلتفرم ابری doprax.com
copyright © 2015-2023